一、库内甜瓜的堆码 甜瓜经过挑选、分级装入箱子，搬入贮藏库。果垛与墙壁及库顶之间应留有一定的距离，便于通风换气。一般每立方米可放果实100－150公斤。有些产瓜区，甜瓜在贮藏库不是装箱贮存，而是成堆敞放，即在贮藏库内用竹、木、钢筋及芦苇、秸秆等搭成架子，再把甜瓜分层整齐地摆在架子上。
二、贮藏库和包装材料的消毒
把包装材料放在贮藏库中，用熏硫方法，每100立方米容积用硫磺约3公斤。把硫磺与锯末掺在一起，点燃使其发烟，关闭门窗熏两天，然后打开门窗通气。也可以用2%的福尔马林溶液喷洒消毒。
三、库内温、湿度和通风管理
自然温度库的通风降温按季节可分为三个阶段。
1、秋季北方地区白天和夜间气温有一定差别，初入窖的甜瓜，果温和窖温均高，呼吸作用旺盛，加上甜瓜带入的田间热，使窖温升高。这时利用通风设备，把外界的低温引入窖内，降低窖温和果温。
2、冬季气候寒冷，甜瓜经过秋季一段时间的贮藏，已经接近适于贮藏的温度。这时的管理主要是保温防冻，特别要注意防止冷空气突然进入窖内，伤害甜瓜；窖内的通风换气应在白天中午气温较高时进行，换气时间不宜过长。
3.立春以后，气温回升较快，这时的管理主要是防止窖温升高。白天气温高时把窖的门窗和通气孔全部堵塞，夜间外界气温比室温低时，打开门窗和通气孔进行通风换气，尽可能使窖温保持较长时间的低温，以延长甜瓜的贮藏时间。
机械冷藏库和气调库密封性能较好。前者用风机更换库内空气，后者除了调节库内氧气和二氧化碳的浓度比例外，还要采取措施消除库内对甜瓜贮藏不利的气体成分，净化空气。
湿度是影响甜瓜品质的重要因素之一。湿度低，甜瓜损耗多，严重时，甜瓜失水萎缩，影响商品价值。由于库内通风换气使贮藏库内湿度下降，所以要给库内适当加湿，一般以湿度80%－90%为宜。
